Master de pathologie humaine
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Terrains de stage

Les étudiants doivent prendre contact avec les différents responsables des terrains de stage afin de définir les sujets.

MARSEILLE

1- Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses Tropicales. UMR CNRS-IRD 6236 (D. RAOULT) – Faculté de Médecine – 27 bd Jean Moulin 13385 Marseille cedex 5 Tél : 04 91 38 55 17

• Responsable stage : D. RAOULT
Courriel : didier.raoult@univ-amu.fr
Thème : Bactériologie (génomique, post-génomique des bactéries intracellulaires) et thérapeutique anti infectieuse

• Responsable stage : A. LEVASSEUR
Courriel :anthony.levasseur@univ-amu.fr
Thème : Dynamique des génomes et adaptation microbienne
Mots clefs : Evolution, (phylo)génomique microbienne, pathogénicité, microbiologie, bioinformatique, virus géants, maladies infectieuses

• Responsable stage : M. DRANCOURT
Courriel :michel.drancourt@univ-amu.fr
Thème : Bactériologie et génomique bactérienne, mycobactéries et pathogènes anciens

• Responsable stage : C. DESNUES
Courriel :christelle.desnues@univ-amu.fr
Thème : Etude des virus associés à l’homme dans un contexte pathologique et non-pathologique par les nouvelles techniques de séquençage haut-débit
Mots clefs : métagénomique virale, écologie, virome humain, pathologie infectieuse, bioinformatique

• Responsable de stage : G. ABOUDHARAM
Courriel :gerard.aboudharam@wanadoo.fr
Thème : Bactériologie, paléomicrobiologie

• Responsable de stage : JM ROLAIN
Courriel :jm.rolain@univ-amu.fr
Thème : Bactériologie, virologie et thérapeutique anti-infectieuse

• Responsable de stage : B. LA SCOLA
Courriel :bernard.la-scola@univ-amu.fr
Thème : Bactériologie de l’environnement et pathogénicité, microorganismes associés aux amibes

• Responsable de stage : B. RITEAU
Courriel :beatrice.riteau@univ-amu.fr
Thème : Rôle de l’hémostase dans l’inflammation pulmonaire induite par les virus influenza
Equipe d’accueil : NORT- UMR 1260-1062, 27 boulevard jean moulin, 13005 Marseille
Résumé du projet :
La grippe est une maladie infectieuse et contagieuse, due aux virus influenza, causant des pertes humaines et économiques importantes. Très souvent banalisée, la grippe constitue pourtant un problème majeur de santé publique à l’échelle planétaire. Les infections humaines récurrentes par le virus influenza aviaire de sous-type H5N1 mettent en évidence la menace permanente causée par ces virus. Une meilleure compréhension des interactions entre le virus influenza et son hôte nous permettra de mieux appréhender la physiopathologie de l’infection grippale et donc à terme de mieux protéger la population.
Lors d’une grippe sévère, une réaction inflammatoire disproportionnée de l’hôte est observée. Cette réaction excessive induit des dommages pulmonaires et une forte diminution de la capacité respiratoire des patients pouvant aller jusqu’au décès, dans les cas les plus graves.
L’hémostase (ie : hemostase primaire, coagulation et fibrinolyse) et l’inflammation sont des processus intimement liés. Récemment nous avons démontré l’importance de l’activation plaquettaire et de la fibrinolyse dans l’inflammation excessive induite par les virus de la grippe. En accord, il a été récemment démontré que les cellules endothéliales orchestrent l’orage de cytoquines, observé lors d’une infection grippale.
Le but de ce projet de stage est de mieux comprendre les relations entre l’hémostase et l’inflammation dans la pathogénicité des virus influenza. Dans ce projet, nous étudierons plus précisément le rôle des plaquettes et de la thrombine dans la pathogénicité des virus de la grippe. De manière intéressante, nous testerons le rôle protecteur de molécules déjà autorisées sur le marché, contre des souches de grippes hautement pathogènes et H1N1 pandémiques.
Ce projet permettra de mieux comprendre les mécanismes qui sous-tendent la dérégulation de l’inflammation lors d’une infection grippale et nous permettra de proposer de nouvelles stratégies thérapeutiques contre la grippe.

• Responsable de stage :P. GAUTRET
Courriel :philippe.gautret@ap-hm.fr ou philippe.gautret@club-internet.fr
Thème : Epidemiologie des maladies infectieuses associées à la mobilité internationale
Mots clefs : surveillance syndromique, surveillance microbiologique, perception des risques, émergences, infections, voyageurs, migrants, grands rassemblements

• Responsable de stage : P. PAROLA
Courriel : philippe.parola@univ-amu.fr
Thème : Maladies infectieuses émergentes, épidémiologie, études des vecteurs

• Responsable de stage : P. BROUQUI
Courriel :philippe.brouqui@univ-amu.fr
Thème : Hygiène, contagion, infection hospitalière, technologie​

• Responsable de stage : E. GHIGO
Courriel :eric.ghigo@univ-amu.fr
Thème : Biologie cellulaire des infections à bactéries intracellulaires

• Responsable de stage :C. FORESTIER
Courriel :claire-lise.forestier@inserm.fr
Thème : Intéraction hôte-parasite : biologie cellulaire et immunologie de la leishmaniose viscérale

• Responsable de stage : B. DESNUES
Courriel : benoit.desnues@univ-amu.fr
Thème : Facteurs de virulence bactériens, étude protéome/transcriptome

• Responsable de stage : J-L MEGE
Courriel :jean-louis.mege@univ-amu.fr
Thème : Immunologie des infections à bactéries intracellulaire : modèles animaux et étude clinique

• Responsable de stage : F. BRETELLE
Courriel : florence.bretelle@mail.ap-hm.fr
Thème : Grossesse et infection, étude immunopathologique

• Responsable de stage : J.F. TRAPPE
Courriel :jean-Francois.trape@ird.sn Autres coordonnées : Institut de Recherche pour le Développement BP 1386 - CP 18524 Dakar SENEGAL Tel : +221 33 849 35 82 / 84 Fax : +221 33 832 43 07
Thème : Paludisme / Plasmodium / Epidémiologie /Borrelia/ Fièvre récurrentis à tiques.

2-Enveloppe Bactérienne, Perméabilité et Antibiotiques (J.M.PAGES)- Faculté de Médecine –27 bd Jean Moulin 13385 Marseille cedex 5 Tél : 04 91 32 45 87, Fax : 04 91 32 46 06

• Responsable de stage : J-M PAGES
Courriel : jean-marie.pages@univ-amu.fr
Thème : Perméabilité membranaire bactérienne, mécanisme de résistance

• Responsable de stage : J-M BOLLA
Courriel :jean-michel.bolla@univ-amu.fr
Thème : Campylobacter et facteur de virulence

3 –Pharmacogénétique des maladies parasitaires EA864 (D. PARZY) : IMTSSA Bd Charles Livon, Parc du Pharo, 13007 Marseille- Tél : 04 91 15 01 14 ; Fax : 04 91 15 01 64 - Faculté de Pharmacie (F. FUMOUX)- 27 bd Jean Moulin 13385 Marseille cedex 5 Tél : 04 91 83 55 61, Fax : 04 91 80 36 74

Contacts : D. PARZY, F. FUMOUX, G. BALANSARD, P. RIHET, P. GAZIN, N. AZAS, C. DIGIORGIO, E. OLLIVIER.
Thème : Maladies parasitaires (Génétique, cible thérapeutique)
Courriel :d.parzy@free.fr
Courriel : fumoux@luminy.univ-mrs.fr

4 - I.M.T.S.S.A. Unité de Parasitologie (Y. BUISSON), Jardin du Pharo - 57 bd Charles Livon 13007 Marseille.
Tél : 04 91 15 01 50, Fax : 04 91 15 01 14

• Responsable de stage : C. ROGIER
Courriel : christophe.rogier@wanadoo.fr
Thème : Réponses immunologiques aux expositions aux arthropodes vecteurs et à la transmission du paludisme, Epidémiologie des infections & maladies à transmission vectorielle

• Responsable de stage : B. PRADINES
Courriel : bruno.pradines@free.fr
Thème : Sensibilité de P. falciparum aux antipaludiques et mécanismes d’action

• Responsable de stage : T. FUSAI
Courriel : thierry.fusai@free.fr
Thème : Interactions moléculaires et physiopathologie du paludisme, immuno-biochimie des protéines

5 – Emergence des Pathologies Virales. UMR UAM2-IRD190 (X. DE LAMBALLERIE) - Faculté de Médecine – 27 bd Jean Moulin 13385 Marseille cedex 5 Tél : 04 91 32 45 53, Fax : 04 91 32 44 95

• Responsable de stage : X. DE LAMBALLERIE
Courriel :xavier.de-lamballerie@univ-amu.fr
Thèmes : Epidémiologie moléculaire des viroses, thérapeutique antivirale, génomique

• Responsable de stage : R. CHARREL
Courriel : remi.charrel@univ-amu.fr
Thème : Epidémiologie moléculaire des viroses, thérapeutique antivirale, génomique

• Responsable de stage : I. LEPARC-GOFFART
Courriel : isabelle.leparcgoffart@gmail.com
Thème : Virologie tropicale
Mots clés : dengue, chikungunya, arbovirus

• Responsable de stage : G. QUERAT
Courriel : gquerat@marseille.inserm.fr
Thème : Interaction flavivirus / systèmes de défense cellulaires

6 – Centre Immunologie de Marseille et de Luminy 163 av. de Luminy – case 901 – 13288 Marseille cedex 09 Tél : 04 91 26 93 15, Fax : 04 91 26 94 30

Contact : J-P GORVEL
Thèmes : Interation hôte pathogènes : brucella, salmonella

7 – Institut de Cancérologie de Marseille, UMR S891 INSERM (F. BIRG) – Institut Paoli Calmettes – IFR 137 – Institut de Cancérologie et D’Immunologie de Marseille – Université de la Méditerranée – 27 Bd Lei Roure – 13009 Marseille Tél : 04 91 75 84 15, Fax : 04 91 26 03 64

Contact : I. HIRSCH
Courriel : ihirsch@marseille.inserm.fr
Thèmes : Infection ex vivo du tissu lymphoïde et hépatique par le virus de l’hépatite

8- Laboratoire d’Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques, UMR 7257-AFMB (Y. BOURNE).
Equipe Réplicases virales : mécanismes, structure & drug-design.
Campus de Luminy - Polytech/ESIL - Case 925 - 163, Avenue de Luminy - 13009 Marseille. Tél : 04 91 82 86 28

• Responsable stage : I. IMBERT
Courriel : Isabelle.Imbert@afmb.univ-mrs.fr
Thème : Virologie, Biochimie, SARS-Coronavirus, identification de nouvelles thérapies anti-virales

MONTPELLIER

1 – IFR 122 : CPBS (C. Devaux), CRBM (P Mangeat) et IGMM (JM Blanchard)
• L’UMR1133 « Ecologie microbienne des insectes et interactions hôte-pathogène » ;
• L’UMR1231 (Directeur Noël Boemare) : « Biologie intégrative et virologie des insectes » et "Génomique fonctionnelle et facteurs de virulence"
• l’UMR5124 (Directeur Georges Lutfalla) : « Défenses antivirales et antitumorales »
• l’UMR5539 (Directeur Henri Vial) : « Dynamique moléculaire des interactions membranaires
• l’UMR 9926 (F Renaud) : Génétique et évolution des maladies infectieuses » (VIH, Dengue, Chikungunya, Parasites)
• URO35 (G. Cuny) : ) : Trypanosomoses africaines
• URO16 (D. Fontenille) : Caractérisation et contrôle des populations de vecteurs
• CNRS UPR1142 IGH (Directeur : Marcel Méchali), équipes de Monsef Benkirane : Régulation transcriptionnelle du promoteur du VIH, et Pierre Corbeau : Virologie moléculaire et transfert de gènes

2 – UMR 145 « VIH et Maladies associées », IRD (E DELAPORTE) – 911 avenue Agropolis – BP 64501 – 34394 Montpellier cedex 5 Tél : 04 67 41 61 56, Fax : 04 67 41 67 46

Contact : E DELAPORTE
Thème : Polymorphisme des rétrovirus HIV/SIV et ses conséquences pour la santé humaine
Courriel : eric.delaporte@mpl.ird.fr

GRENOBLE

1 - Virologie Structurale et Moléculaire EA 2939 (J.M. SEIGNEURIN) – CHU Grenoble - La Tronche BP ORAND 217 38043 GRENOBLE CEDEX 9 Tél : 04 76 76 56 04, Fax : 04 76 76 52 28

Contact : J.M. SEIGNEURIN
Thème : Virus Epstein Barr et virus de l’hépatite C
Courriel :Jmseigneurin@chu-grenoble.fr

2 - GREPI EA 2938 (F. MOREL) - CHU Grenoble - La Tronche BP 217 - 38043 GRENOBLE, CEDEX 9 Tél : 04 76 76 54 83, Fax : 04 76 76 56 08

Contact : F MOREL
Thème : Interaction Pseudomonas aeruginosa-neutrophiles
Courriel : Frmorel.enzymo@chu-grenoble.fr

3 – UMR CNRS UJF 5163, Laboratoire Adaptation et Pathogénie des Microorganismes (MF. CESBRON DELAUW) – Institut Jean Roget- Campus santé – Domaine de la Merci – 38700 La Tronche Tél : 04 76 63 74 63, Fax : 04 76 63 74 97

Contact : MF CESBRON-DELAUW
Thèmes : Parasitisme intracellulaire, Epigénétique et parasites, Interactions hôte-pathogène, Dynamique et évolution des génomes microbiens
Courriel : marie-france.cesbron@ujf-grenoble.fr

4 - CRESSA Unité Virologie (D GARIN) – 24, av des Maquis du Grésivaudan, BP 87, 38702 , La Tronche cedex. Tél : 04 76 63 68 44, Fax : 04 76 63 69 17

Contact : D GARIN
Thème : Virologie Moléculaire
Courriel : daniel.garin@wanadoo.fr

DIJON

1 - Laboratoire de Microbiologie médicale et Moléculaire EA 562 (H POTHIER) -Maison de l’Université Esplanade Erasme 21078 DIJON CEDEX BP 2787 Tél : 03 80 29 34 29, Fax : 03 80 29 36 04

Contact : H POTHIER
Thème : Modèles animaux en virologie
Courriel : Pierre.Pothier@u-boourgogne.fr

SAINT-ETIENNE

1 - G.I.M.A.P. EA 3064 - Faculté de Médecine (C. GENIN) - 15 r Ambroise Paré 42100 SAINT ETIENNE Tél : 04 77 82 83 79

Contact : C GENIN
Thème : Etude de l’immunité des muqueuses au cours de l’infection à VIH en vue d’un vaccin par voie locale.
Courriel : christian.genin@univ-st-etienne.fr

NANTES

1 – Génétique des Interactions Hôte-Microorganismes » JE 2437, IFR 26 (B-M IMBERT) Université de Nantes – 1 rue Gaston Veil - 44035 NANTES cedex 01 Tél : 02 40 41 29 52, Fax : 02 40 41 28 41 Réservé Interne

Contact : Pr F RAFFI
Courriel : francois.raffi@chu-nantes.fr

LILLE

1 - Détresse Respiratoire et Circulatoire EA 2689- Laboratoire de Physiologie (R. MATRAN) – Faculté de Médecine- Pôle Recherche- 1 place de Verdun – 59045 Lille cedex. Tél : 03 20 69 44 30, Fax : 03 20 69 44 39

Contact : B. GUERY
Thème : Bactériologie, Maladies Infectieuses
Courriel : bguery@invivo.edu

NICE

1 – Service d’Infectiologie (P. DELLAMONICA) Hôpital Archet 1, BP 3079 - 06200 Nice, cedex 3, Tél : 04 92 03 55 15

Contact : P-M ROGER
Thème : Bactériologie, Maladies Infectieuses
Courriel : Infectiologie@chu-nice.fr

2 – INSERM U627, Toxines bactériennes dans la relation hôte-pathogène (E.
LEMICHEZ) - UFR Médecine - 28 av Valombrose 06107 NICE

Contact : E LEMICHEZ
Thèmes : bactériennes protéiques (http//www.unice.fr/inserm-toxin-bacteria/)
Courriel : emmanuel.lemichez@unice.fr

TOULOUSE

1 – EA 3038, Laboratoire d’Immunovirologie (E BAHRAOUI) – Université Paul SABATIER -118 rte Narbonne 31062 TOULOUSE CEDEX 4 Tél : 05 61 55 86 67

Contact : E BAHRAOUI
Thème : VIH et Immunologie
Courriel : Bahraoui@cict.fr